地球科学与工程学院在国家“211工程”、“985工程”重点建设学科中，拥有“地质学”一级国家重点学科和“水文学与水资源”专业国家重点学科培育点。“水文学与水资源”专业又属江苏省重点学科。经教育部批准设有国家理科地质学人才培养基地和国家级实验教学示范中心。“普通地质学”、“地球系统科学”二门课程被评为国家精品课程。地质学和水文与水资源二专业被列为教育部第二类特色专业建设点，地质学、地球化学二专业列为江苏省品牌专业，水文与水资源、地质工程二专业被评为江苏省特色专业。
人才培养与科学研究是学院的两项基本任务。在人才培养方面，主要造就高素质、宽基础、创新型人才，从品德、知识、能力三方面进行全面培养。本科教学的课程体系包括宽厚的基础课、核心必修课和前沿选修课。培养期间，进行两次野外实践教学：普通地质实习（以南京湖山为基地）和区域地质测量实习（以安徽巢湖为基地）。强调教学与科研融通，优秀本科生可以免试保送研究生，优秀硕士生实行硕博连读。近年来，出版各类教材20余种，获得国家级教学成果奖7项，部省级教学成果奖15项。在科学研究方面，近年来承担国家973计划、国家863计划、国家自然科学基金、国家重大科技攻关项目以及企事业委托或国际合作项目共500余项，年科研经费达2500多万元。获部省级科研成果奖50余项，每年发表论文总数超过200篇（其中SCI期刊论文近百篇）。