南京大学计算机科学与技术系在全国最顶尖的九所高校（C9）中，人才培养独树一帜，平台优势突出，是中国计算机和软件人才的摇篮。建有计算机科学与技术一级国家重点学科和计算机软件新技术国家重点实验室，在人才培养和科学研究方面位居全国领先行列。国内最早从事计算机教学与科研的单位之一，50余年的发展历史铸造出众多辉煌成就：研制成功我国第一个高级语言编译程序、第一个国产机操作系统；培养出我国第一个软件工学博士；我国首批计算机软件重点学科；我国首批计算机科学与技术国家一级重点学科；计算机软件新技术国家重点实验室目前是优秀类国家重点实验室、在全国计算机领域排名第一；“面向Internet的软件方法与技术”研究团队被评为国家自然科学基金委员会创新群体。
师资力量
现有教授32人（含博士生导师29人），副教授、高级工程师34人，其中中国科学院院士1人、国务院学位委员会学科评议组成员1人、国家级突出贡献中青年专家3人、国家百千万人才工程计划入选者2人、教育部长江学者特聘教授2人、国家杰出青年科学基金获得者5人、教育部新（跨）世纪人才培养计划入选者14人，还包括1个国家自然科学基金委员会创新群体。全系教授中80%以上担任本科生教学工作，其中包括吕建和周志华两位教育部长江学者特聘教授。
ACM全球总决赛
科研成果
计算机的灵魂是软件，计算机的未来是智能，软件和智能均为南京大学计算机科学与技术系的优势科研领域。主要研究方向有：软件方法学与软件质量保障、人工智能与机器学习、分布计算与并行处理、多媒体与计算机图形学、信息安全与系统软件等。近年来共承担国家“973”计划、“863”高技术计划、国家自然科学基金、国家杰出青年科学基金、省部委、国际合作与横向协作项目等400余项；在国内外重要学术期刊和会议发表论文3000余篇，其中国外刊物314篇，SCI、EI检索论文1400余篇次，一些成果被国内外学者广泛引用，在相关领域产生了重要影响。共获国家和省部级奖励63项，其中国家科技进步二等奖3项，省部级特等奖2项、一等奖9项、二等奖24项，两部学术专著获国家教育部优秀教材一等奖。申请及已获授权的专利总数达175项，其中授权56项。
国际交流与合作
该系国际学术交流活动十分活跃，是国内计算机领域的国际学术交流中心之一，每年有逾50位国外学者来我系交流、讲学，例如图灵奖首位女性得主Frances E. Allen于2010年访问我系为本科生做励志报告；每年均举办多次国际学术会议，为学生了解学科发展前沿、进行国际学术交流提供了平台和渠道。每年都有本科生到美国、加拿大、澳大利亚、日本、韩国、新加坡、香港和台湾等国家和地区的著名大学进行交流学习。与国际著名的IT企业有着广泛联系，每年均有学生到微软、IBM等公司实习；IBM、APPLE 等公司也在我系建立联合实验中心，为毕业生就业拓宽了渠道。
人才培养
建有国内一流的专业培养体系和培养平台，强调基础训练，重视实践能力，鼓励多元成长。建有国家“基础学科拔尖学生培养试验计划”的计算机科学基地班，开放所有科学研究实验室和团队并鼓励学生进入，让学生早期就在科学研究和系统开发过程中“从游”于导师以及学长。如我系2007级本科生李昂以”第一作者、在校本科生”身份在2010年计算机视觉的国际顶级会议发表学术论文。该系建设有以苹果技术为代表的先进技术与产业体验中心，与多个国际知名企业建有实践、实习基地，让学生在校期间就充分接触产业动态和企业文化。在跨学科能力培养中，允许并鼓励部分学生在物理、电子、数学、商学进行课程选修。