全系现有教师64人,其中教授24名(包括长江计划特聘教授3名、国家杰出青年基金获得者4名、博士生导师20名,副教授28名,具有博士学位的教师占教师总数的90%。现有在校本科生学生约560人,博士、硕士研究生181人、在站博士后研究人员10人。在各主流学科方向均有博士生导师作为学科带头人。该系的教师先后参加国家“攀登计划”中的非线性科学项目、“863计划”、“973项目”、数学天元重点资助项目、国家自然科学基金项目等重大科研项目,并承担多项与经济建设、社会发展密切相关的研究课题,取得了较大的经济效益。在近几年完成的70余项国家及部、省级科研项目中,获得各类奖励30余项,其中有国家自然科学二等奖、中国高校自然科学一等奖,江苏省科学进步一等奖等高级别奖项。特别是近2013年来一些青年学者已成为各学科的学术骨干和学术带头人,取得了一些具有国际影响的成果,已获得2项“求是杰出青年学者奖”和1项“晨兴数学奖”,有3人被聘为教育部长江学者奖励计划特聘教授,4人获得国家杰出青年基金,2人获得教育部优秀青年教师奖励基金。该系长江计划特聘教授程崇庆为首届“晨兴数学奖”唯一一位中国内地获奖者。
依托数学系南京大学成立了现代数学研究所,所长为中科院院士、美国麻省理工学院教授田刚博士。该所的工作为科学研究、学术交流和高层次数学人才(硕士、博士)的培养提供了一个平台。
该系图书室藏有国内外(主要是国外的)各种数学书籍、期刊等6万余部(种),是国内高校少数的几所收藏较为齐全的数学专业图书室之一。系微机中心实验室设备齐全,为教学实习和科研提供了良好的条件。该系还主办全国《高等学校计算数学学报》、《南京大学学报数学半年刊》、《分析,理论及应用》等国内数学核心期刊。