本系依托于南京大学已有的基础学科人才培养的优势，以及在固体微结构物理国家重点实验室基础上形成的在功能材料方面研究的积累, 建立了根据综合性院校材料科学人才培养发展的需要，建立了本系材料物理与材料化学两个专业的教学体系。确立了：“重视数、理、和化学基础，强调材料科学的基础理论，注重实验技能培养的教学体系；以培养学生在材料科学领域，特别是功能材料领域中，从事材料设计、材料制备、材料表征和材料性能几方面研究和应用工作的创新能力和实践能力”的教学思想和培养目标。形成了以学科前沿研究带动人才培养，以教学研究促进学科发展的模式。在课程设置上一方面秉承南京大学在数理基础理论和基础实验教学方面的深厚积累，同时大力开展专业基础课和专业课的建设，注重学科交叉，强调光电子技术基础和材料微结构与性能之间的相互关系，逐步建立了包括材料科学与工程导论、材料物理、材料表征、光电子学、薄膜工艺、材料科学进展等涵盖材料科学的基础理论、技术应用以及发展前沿的完整方面的课程体系，形成了以基础性、先进性和实用性为标志，包含材料制备、加工处理、结构表征和性能测试诸方面的专业教学实验室体系。在理论和实验课程教学中，积极鼓励学生参与教师的学术研究，使学生尽早接触材料科学研究的最前沿。这种基础理论、实践能力和创新能力并重的教学模式，使学生在先进功能材料，特别是光电功能材料的设计、制造和应用方面受到了良好全面的训练，具有宽广的发展潜力。在本科教学的基础上，研究生培养与学科建设亦获得了很大的发展，相继建立了“材料物理与化学”、“材料学”等工学博士点与硕士点，培养了一批高素质的材料学科硕士和博士，取得了一批受到同行瞩目的研究成果。
　　自1993年成立以来，取得了3年一大步的大发展：1994年获材料物理学士学位授予权；1997年获得材料物理与化学工学硕士点；2000年获得材料物理与化学工学博士点;2005年，本学科成为江苏省重点学科，2007年本学科成为国家重点学科。材料科学与工程系现有材料物理与材料化学两个本科专业，每年招收本科生100余人。并建有材料物理与化学和材料学工学硕士点和博士点，每年招收硕士和博士研究生近40人。目前，人才培养的规模仍在稳步发展中。材料科学与工程系主持了两届全国高等学校材料物理与化学教学指导委员会的工作，对理科综合性院校的材料科学学科建设起了示范和指导作用，在国内外产生了一定的影响。