信息管理学院还建有“国家信息资源管理南京研究基地”、“南京大学中国人文社会科学评价创新基地”、“新闻出版总署南京大学出版人才培养基地”、“国家保密培训基地南京分基地”四个国家级基地；“南京大学信息产业研究所”、“南京大学信息技术开发研究所”和“南京大学出版科学研究所”三个校级研究机构。建有“信息数字化集成实验室”、“情报分析综合实验室”、“多媒体技术研究实验室”等研究型实验室和信息技术教学实验室，并与国家图书馆、中国科技信息研究所、中国出版集团等战略合作伙伴正筹建数字图书馆联合实验室、网络出版实验室和出版研究院。