坐落于浦口校区，2007 年5月落成使用，它是由香港陈曾焘先生暨思源基金捐资人民币 2000 万元助建的，总建筑面积 30510 平方米 ，地下一层，地上五层。图书馆所使用面积为 10000 平方米 。思源图书馆是南京大学图书馆设在浦口校区的文献信息服务中心，现设图书借阅室、书刊阅览室、多媒体阅览室和影视鉴赏室等，共收藏中外文书刊 30 多万册，DVD、VCD、CD-ROM等 2000 多件，为读者提供书刊借阅、文献复制、网上查询、影视鉴赏、通借通还、读者培训等基础服务。浦口校区思源图书馆收藏了 80 多个国家和地区 20 多个语种的期刊。浦口校区思源图书馆在教育主管部门的支持下，全国高校的地科(地质、地理、气象、天文、环境科学)教材中心、文科文献中心相继建成，进一步增加了馆藏内容和特色。