电子系现有“近代声学”国家重点实验室、声学研究所、生物医学电子工程研究所、通信技术研究所、超导电子学研究所、软件研发中心和微波技术研究室等科研机构。“近代声学”国家重点实验室是我国仅有的两个国家级声学基础研究基地之一。声学研究所的科学研究横跨从基础到应用的大多数声学前沿领域，其学术水平长期处于国内领先水平，在国际上享有较高的学术声誉。生物医学电子工程研究所、通信技术研究所和软件研发中心等科研单位直接面向国民经济主战场，注重科研成果的转化，在国民经济建设中发挥了积极的作用。微波技术研究室坚持从基础研究到应用研究的发展主线，所研制成的新型电磁隐形材料已经产业化，为我国国防现代化做出了重要贡献。近几年来，超导电子学研究所异军突起，已经成为我国主要的超导电子科学研究基地，在我国电子科学技术发展中正在发挥日益突出的作用。
电子系电子信息类学科的建设生机勃勃,已经在嵌入式系统设计、电子设计自动化、生物识别技术和现代信号与图像处理等IT前沿领域形成了扎实的学科基础,其应用开发深入国民经济主战场,显示出强劲的活力和社会吸引力。