南京大学工程硕士在职研究生考试方式如下：
工程硕士研究生入学考试采用两段制考试方式。第一阶段，所有考生参加国家统一组织的硕士学位研究生入学资格考试（简称GCT，成绩一年有效）。该阶段主要测试考生的综合素质（GCT试卷由四部分构成：语言表达能力测试、数学基础能力测试、逻辑推理能力测试、英语运用能力测试，满分400分，每部分100分；考试时间为3个小时）。GCT 命题依据《硕士学位研究生入学资格考试指南》（科学技术文献出版社），命题及阅卷工作由教育部学位与研究生教育发展中心统一组织。第二阶段，符合我校GCT分数要求者持本人的成绩单，到我校申请参加学校自行组织的专业综合考试。我校将根据GCT成绩和专业综合考试结果择优录取。