南京大学管理学院设有工商管理系、会计学系、电子商务系、市场营销系、人力资源管理学系5个系，同时设有整合全院研究力量的企业战略研究所、人力资源战略研究所、市场研究与咨询中心等研究机构。这些系所承担了5个本科专业（工商管理、会计学、财务管理、电子商务、市场营销）、2个硕士点（企业管理、会计学）、1个国家一级学科博士点（工商管理）、4个二级学科博士点（企业管理、 人力资源管理、技术经济与管理、会计学）的教学与科研工作。